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葡京备用网址:“DNA元件百科全书”

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北京7月30日电 (记者 孙自法)致力于绘制人类与小鼠基因组功能性元件综合图谱的“DNA元件百科全书”(ENCyclopedia of DNA Elements,ENCODE)计划,最新公布了其第三阶段超过120万个人类与小鼠体内调控基因的候选功能性元件。


  施普林格·自然(Springer Nature)旗下学术期刊《自然》《自然-方法》《自然-通讯》通过最新发表的14篇论文合集,描述了“DNA元件百科全书”第三阶段公布的结果,这将为基因组组构和功能带来新的认知。

  “DNA元件百科全书”计划于2003年启动,功能性元件是指编码具有调控基因作用的分子产物或生化活动的DNA区域。

  在《自然》发表的一篇概述性文章中,美国麻省大学医学院翁志萍和同事,在“DNA元件百科全书”计划前两个阶段上扩展增加的近6000项新实验(4834项涉及人类样本,1158项涉及小鼠样本),之前阶段的大部分研究使用的都是模型细胞系,而第三阶段包含了超过1369个生物样本来源的503种细胞或组织类型。根据该计划已经绘制出的数百万个元件,研究人员还建立一个在线注册库,里面包含了926535个人类的和339815个小鼠的候选顺式调节元件(调节基因转录的非编码DNA区域),覆盖到各自基因组的7.9%和3.4%。

  14篇论文合集中的其他论文,利用“DNA元件百科全书”的数据集揭示决定部分功能性元件作用方式的原理。例如,美国斯坦福大学迈克尔·斯耐德(Michael Snyder)和同事,绘制出24种人类细胞类型内染色质(DNA与蛋白的复合物)的相互作用,发现不同细胞间的染色质环状结构差异会影响基因表达。
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